疾病管制署(下称疾管署)2026年10月6日表示，115年度公费流感及新冠疫苗自10月1日起正式开打，截至10月5日，流感疫苗接种数约106.2万人次、新冠疫苗亦接种约39.5万人次，均较去(2025)年同期高，随着双十假期将至，连假出游使人群交流频率增加，而疫苗接种约需2周的时间才能获得足够保护力，请民众尽早前往合约院所接种流感及新冠疫苗，早日获得保护力，守护自身与家人健康。

依据疾管署监测数据显示，国内流感疫情持平仍处流行期，第39周(9/27-10/3)类流感门急诊就诊计139,060人次，较前一周略降1.4%。另上周(9/29-10/5)添加219例流感并发重症病例(210例H1N1、1例H3N2、7例A未分型、1例B型)及44例死亡(41例H1N1、1例H3N2、2例A未分型)。依实验室监测数据显示，目前社区中流行之流感病毒以A型为主，其中以A型H1N1占90.7%为高。本(115-116年)流感季累计30例重症病例(均H1N1)；上(114-115年)流感季累计1,862例重症病例(1,225例H1N1、511例H3N2、35例A未分型、91例B型)及378例死亡(247例H1N1、107例H3N2、12例A未分型、12例B型)，其中重症病例以65岁以上长者(占66.4%)及具慢性病史者(占83.6%)为多，67.2%未接种该季流感疫苗。新冠疫情部分，国内新冠肺炎疫情下降，惟仍处流行期，第39周(9/27-10/3)新冠门急诊就诊计7,836人次，较前7日(9/24-9/30 )下降26.7%；上周(9/29-10/5)添加37例本土重症病例及16例本土死亡病例。 本季(2026/10/1-2027/9/30)累计12例本土重症，尚无死亡病例；上一季(2025/10/1-2026/9/30)累计781例新冠并发重症本土病例，其中163例死亡，重症病例以65岁以上长者(占73.6%)及具慢性病史者(占83.0%)为多，83.9%未接种该季新冠疫苗；近4周本土病例变异株以PQ.16.1.1及NB.1.8.1。

疾管署呼吁，长者、幼儿及慢性病患等高风险族群应尽速完成流感及新冠疫苗接种，获得保护力，并降低感染后发生重症和死亡之风险，提醒民众连假出游、聚餐机会增加，务必做好手部卫生与咳嗽礼节，落实勤洗手、有发烧、咳嗽等类流感症状戴口罩及生病在家休息等措施，如有危险征兆，包含呼吸急促、呼吸困难、发绀、血痰、胸痛、意识改变、低血压等)应尽速就医，以及时获得诊治。新冠疫苗合约医疗院所等相关接种信息可至疾管署万维网首页「115年度左流右新护肺顾心疫苗接种专区」或至各县市卫生局官网查阅。