受到中秋連假門診休診影響，國內上週類流感門急診達13.8萬人次，雖然較前一週略微下降，但疫情仍處於高點，上週新增87例重症及30例死亡，死亡數追平本流感季新高紀錄。 值得注意的是，死亡個案中年紀最小的是南部2歲男童，9月上旬高燒40℃，到診所就醫快篩為A型流感，隔天意識不清送醫院急診，檢查發現有腦水腫，後續病程快速惡化，住院2週左右仍不幸過世。 疾管署防疫醫師林詠青指出，「他的這個症狀一直沒有改善，而且後來的這個腦部電腦斷層顯示，他的腦水腫其實有惡化的狀況，那研判是有這個造成這個急性壞死性腦炎，那在這個9月下旬的時候，還是不幸的過世。

」為了加強民眾保護力，公費流感及新冠疫苗第一階段將於10月1日起開打，不過傳出莫德納藥廠近年研發「流感+新冠」二合一疫苗，歐洲去（2025）年已經通過疫苗藥證，最快明（2027）年就可供民眾接種，也就是只要打一針，就能同時預防2種疾病，外界關心台灣是否也有機會引進或開放公費接種「流感+新冠」二合一疫苗呢？ 疾管署發言人林明誠表示，「所有台灣接種的疫苗，我們都會提到疫苗接種委員會去討論，那討論的話，不外乎兩個重點，一個是疫苗的效益、保護的效力啦，一個是疫苗的價格。

」疾管署強調，10月1日起，年滿18歲民眾只要接種新冠、流感及肺炎鏈球菌疫苗，就可分別獲得900、450及600健康幣，若3種同時接種就可賺到1950健康幣，且自費接種也算，累積之健康幣可於12月起兌換健康商品。 疾管署提醒，流感疫情目前正處於高峰，要到10月中旬才會反轉向下，建議民眾接種疫苗，可以降低感染後併發重症及死亡的風險。