畜牧业者忙着清理牧场，过去这些畜牧废水在云林县每年约有百万公吨经处理排入河川，但为了让水资源循环再利用，云林县环保局从2016年推动沼渣沼液再利用，将畜牧废水转成灌溉肥份来源，让农民慢慢接受。 云林农民说道，「是会比较有肥份，但也是要检查看有没有毒，如果没有毒是没关系，因为现在稻子收成都要经过检查。 」云林县环保局表示，目前云林1200多场畜牧场中，已有950场投入畜牧资源化行列，每年可减少260万公吨畜牧废水排入河川，而近期又在元长乡、林内乡试办推动畜牧废水资源化及智能灌溉，若未来能扩大到全县畜牧场，一年可省下1.75亿吨水。

云林县环保局长张乔维说明，「导到农田里面，那我们会去参配比例，然后就直接做浇灌、做精准灌溉，这样子跟传统比较有什么好处，我们大概可以节省1.75亿吨水，是新竹科学园区2年的用水量。 」环保局就说，云林是农业与畜牧大县，若能通过集成畜牧肥分、农田灌溉、环境监测及智能控制技术，让回收的畜牧废水混合农田灌溉水，能大幅提升用水效率，将原本污染废水转化为农业资源。