环团架设摄影机，在台糖沙仑农场的草地上，拍到草鸮在夜间现身，沿着草地低飞。 环团表示，这是草鸮在低飞找老鼠的觅食画面，牠的活动范围在半径1平方公里内，不过这里将来却要变成南科4期用地，将对草鸮生存带来莫大威胁。 台南社区大学研究发展协会研究员晁瑞光指出，「附属设施的地方，其实也是草鸮活动的热区，尤其在近2个月牠几乎天天出现，这边大概有巢位在这里，这个地方必须要回避开发。 」环团指出，南科4期预定地涵盖树栖型与草生2种生态，尽管开发单位提出生态栖地补偿计划，但在草地面积上，虽然区内外留有138公顷，但损失栖地却高达263公顷、不增反减，对草鸮而言根本是霸凌。

台南社区大学研究发展协会召集人黄焕彰表示，「负124公顷，那我们的规划里面为什么这么不公平？ 为什么这么霸凌草鸮，给草鸮的就是一个破碎化的补偿地，而且面积不足。 」面对草鸮数量恐怕低于300只，环团质疑，台积电董事长魏哲家在6月股东会时喊出，希望让牠成长到400只，以目前的保育计划恐难达成。 针对环团不满草地栖地补偿面积较少，对草鸮不公平；南科管理局表示未来会调整，但也必须兼顾其他物种的保育。 南科管理局副局长李信昌回应，「大家能够找到一个平衡点，既能够兼顾到其他非草鸮的保育，那当然我们重视的草鸮，也能够让大家找到一个比较好的解决方案。

」针对环团指出，园区规划的停车场与零废中心是草鸮繁殖巢位应该完全回避开发、划设保育区，南科管理局则回应，将纳入替代方案评估。