走進靠名古屋港建設的選手村，70平方公尺的貨櫃屋，最多要住4個人，讓不少高大的外籍選手，抱怨空間太小。 日本愛知名古屋亞運從開幕以來問題不斷，不只沒蓋選手村，採用郵輪跟貨櫃屋應對，還出現貨櫃屋漏水、男女選手同寢室的離譜情況。 名古屋亞運組委會住宿二課負責人松雄裕太表示，「在如何有效地活用既存設施下 ，並同時能妥善滿足運動員的需求，針對這一點，是我們希望繼續改進的方面。 」18日南韓對戰孟加拉的「男子曲棍球」預賽賽前儀式，還把南韓的國歌，放成北韓的國歌，引發南韓不滿抗議，日本主辦單位公開道歉。 而早在15日，歡迎南韓選手團的活動中，居然讓演員扮演日本名將豐臣秀吉，進行表演。

由於歷史上，豐臣秀吉在統一日本後，野心勃勃，在1592年到1598年間，發兵進攻朝鮮半島2次，相當於用侵略南韓的歷史人物歡迎南韓選手團，引發抗議。 飲食方面，工作人員還採用「固定份量發放」，讓泰國台克球代表隊總教練，抱怨供餐太少。 還有接駁車把南韓足球選手送到棒球場，甚至放南韓籃球選手鴿子，害選手在決賽比賽前，無法練習。 名古屋亞運組委會秘書處次長大參孝彰回應，「這是重大的疏失，很明顯就是我們的人為疏失。 」名古屋市在2016年，獲得這次亞運舉辦權後，卻因為後續物價暴漲，讓選手村建設預算暴增到3倍，因此放棄蓋選手村。

日媒《週刊文春》還爆出組委會內部機密文件，顯示負責場館建設與營運的法國跨國集團的日本分公司「GL events Japan」，在2025年4月以630億日圓承包工程，進度卻嚴重落後，10月提交的工程清單費用，更暴增到814億日圓，超支184億日圓，導致不少場地無法事先彩排、狀況頻頻。 學者分析，這次亞運分散了選手的住宿區，造成訊息傳達容易出錯。 另外，過去東京奧運、帕奧贊助合約發生的貪腐醜聞，讓這次亞運的組委會體制，由缺乏國際賽事營運經驗的、地方政府公務員擔任，才導致失誤連連。 日中京大學體育科學部教授來田享子表示，「總之，大家被迫要在極力壓縮成本的前提下進行工作，但卻又缺乏足以應付這種狀況的專業經驗與技能。

」這次的亞運到4日就會落幕，目前多數賽事都已經結束，但亞運強制執行「比賽完的隔天，就得退房」的規定，讓不少選手，完全沒有與其他國家選手交流的時間。 種種疏失，也讓這次的亞運，被網友，甚至是選手號稱「史上最爛亞運」。