為構建完善的大新竹大眾捷運路網，新竹縣市政府及新竹科學園區管理局本於區域合作精神，針對大新竹輕軌推動達成「紅藍線整合、機廠共用、納入高鐵延伸線」等共識。目前雙方專案小組已密集召開多次工作會議，持續回歸工程技術與專業軌道審查程序，加速解決跨縣市工程介面。

「新竹縣市輕軌紅藍線整合可行性研究」於2026年3月正式啟動實質評估作業。過去大新竹輕軌紅線可行性研究報告於2022年因尚未納入縣市整合、高鐵延伸及機廠共用等議題，未符合中央審查期待而遭退回；近年在縣市攜手合作下，已正式突破僵局，紅藍線整合可行研究報告預計2027年底提報中央。

為打破既往本位主義，新竹縣長楊文科上任後積極與新竹市政府及新竹科管局溝通，並正式簽署合作備忘錄（MOU），達成「紅藍線整合、機廠共用、高鐵延伸線納入」共識，獲得交通部高度認同。

竹縣府交通處指出，由新竹縣市共同爭取的「新竹縣市輕軌紅、藍線整合可行性研究」於2025年底獲交通部核定補助，並於今（2026）年3月正式決標、啟動實質評估作業。目前雙邊專案小組已密集召開多次工作會議，逐步解決過去被忽視的工程與系統界面難題。

其中包含「紅線路線與場站優化」，「紅線 R10-R01c（高鐵新竹站）」路線進行高架與地下化方案的整體檢討，並研析將紅線終點R10站體調整至東南街，以有效縮短旅客轉乘距離，同時降到對臺鐵主線與機務段營運的衝擊。另外，亦評估將臺鐵竹中站納入紅線站點，滿足竹東地區民眾往返高鐵站的轉乘需求。

「藍線站位與土地開發整合」部分則涉及藍線（BL01（高鐵新竹站）-BL09）路線優化與站位調整，並深化場站周邊土地聯合開發（TOD）與財務效益分析。針對跨越頭前溪、國道1號拓寬高架段等關鍵工程介面進行嚴謹的可行性評估。

此外，「機廠共享與直通營運介面」必須評估於高鐵新竹站（BL01/R01c）設置過軌軌道與中央避車線，打破縣市界線，以實現「紅藍線環狀直通營運」；同時重新尋覓縣市共用的五級機廠廠址，降低重複建置與長期營運成本。

縣府重申，新竹縣政府從未缺席大新竹的未來發展，近年更編列預算自主完成「新竹縣大眾捷運系統整體路網評估計畫」，並獲交通部備查。目前雙邊工作小組運作順暢，目標於2027年底前將日趨完善的「紅藍線整合可行性研究報告」提報交通部審查。未來將持續與新竹市政府緊密合作，積極向中央爭取經費，共同支持「紅藍線齊頭並進」的務實方案，讓大新竹輕軌早日實現。